地质工程系结合办学特色和建系十六年以来的成果积累，依托中国地质大学（北京）对口支援，充分发挥人才资源优势，积极申报科研项目，先后获批立项国家自然科学基金资助面上项目、国家自然科学基金专项项目、国家自然科学基金青年项目、青藏高原第二次科学综合考察研究项目、中国科学院“百人计划”资助项目，青海省自然科学基金项目、青海省科技专项资助项目、中国地质调查局资助项目等科研项目50余项。教师通过开展科研活动，为地方经济建设和社会发展贡献了力量，也有力地提升了教书育人的能力。